Basse vallée du Doubs et étangs associés

**Qualité et importance** : Le site « Basse vallée du Doubs et étangs associés » est une zone riche sur le plan ornithologique. Son avifaune regroupe des espèces particulières et rares, dont certaines sont visées à l'Annexe I de la directive « Oiseaux », telles la Sterne pierregarin, l’Oedicnème criard, l'Aigrette garzette, le Héron bihoreau ou la Gorgebleue à miroir. L’intérêt ornithologique de ce territoire repose sur la diversité des milieux naturels présents permettant à de multiples espèces de s’y reproduire : - des espèces rares liées à la dynamique fluviale du Doubs, - des espèces souvent très rares vivant dans les zones d’étangs marécageuses, - des espèces menacées liées aux prairies et/ou vallées alluviales. L'intérêt patrimonial réside en premier lieu dans la présence de trois espèces nicheuses d'intérêt communautaire liées à la dynamique fluviale active, dont l'Oedicnème criard, espèce en régression à l'échelle nationale, la Sterne pierregarin, formant sur le Doubs sa seule population du bassin de la Saône et la Gorgebleue à miroir blanc pour laquelle on compte son unique site de reproduction pour la Bourgogne. Au niveau des étangs, quatre espèces de hérons d'intérêt communautaire viennent également s'alimenter régulièrement sur le site : l'Aigrette garzette, le Héron bihoreau, le Héron pourpré et le Blongios nain. Autre héron d'intérêt communautaire, la Grande Aigrette compose en basse vallée du Doubs sa plus grande population hivernante de Bourgogne. Les étangs constituent aussi un lieu de reproduction pour plusieurs espèces, dont le Busard des roseaux. Ces milieux représentent une halte migratoire et une zone d’hivernage importantes pour des centaines d’oiseaux, dont le Balbuzard-pêcheur. Au sein des prairies et zones bocagères, 2 espèces d'intérêt communautaire ressortent : - la Pie-grièche écorcheur, qui maintient une population nicheuse assez importante ; - à l'opposé, le Râle des genêts, espèce figurant à la liste des oiseaux mondialement menacés de disparition, est au bord de l'extinction. **Caractéristiques** : Le site est découpé en 5 entités qui peuvent se décomposer en trois zones majeures : - le lit mineur du Doubs entre Fretterans et Navilly et son espace inondable, limité par un réseau de digues où sont présents milieux prairiaux et forêts alluviales ; - la plaine du Doubs, dominée par les terres cultivées mais comportant des espaces prairiaux discontinus notamment entre Navilly et Frontenard et dans les vallées des ruisseaux de la Charetelle et de la Breux, de Charette-Varennes à Pierre-de-Bresse ; - la frange du plateau bressan avec quatre ensembles d’étangs à vocation piscicole (17 étangs au total), bordés principalement de boisements humides et parfois de prairies ou cultures. **Vulnérabilité** : Les travaux hydrauliques menés sur le Doubs à des fins de protection des zones habitées et d'amélioration agricole (construction de digues, enrochements des berges) ont réduit la superficie des zones inondables et prairiales, au détriment notamment de la reproduction du Râle des genêts. La rectification partielle du lit limite localement la création naturelle de bancs de graviers et de berges érodées, au détriment de la Sterne pierregarin, de l'Œdicnème criard et du Martin-pêcheur. L'exploitation des granulats dans le lit du Doubs est à l'origine d'un enfoncement encore perceptible du lit de la rivière, notamment en amont et en aval des fosses d'extraction (Navilly, Lays-sur-le-Doubs). Les habitats connexes au cours d'eau (bras morts, mares, roselières) ne sont plus inondés régulièrement et subissent une accélération du boisement naturel, au détriment du Busard des roseaux, du Blongios nain, du Héron pourpré et de la Gorgebleue à miroir blanc. L'appauvrissement du lit en graviers limite la disponibilité en îles et en grèves favorables à la Sterne pierregarin et à l'Œdicnème criard. L'extraction actuelle et passée de granulats dans le lit majeur de la vallée alluviale (Navilly, Lays-sur-le-Doubs, Fretterans, Pierre-de-Bresse) restreint également la superficie en prairies, mais bénéficie toutefois à certaines espèces nicheuses ou migratrices (Limicoles) en recréant des milieux pionniers artificiels (étendues de graviers, vasières) autour des gravières en eau. La fréquentation humaine de certaines zones du Doubs (essentiellement sur Fretterans et Longepierre) est responsable d'échecs réguliers de la reproduction de la Sterne pierregarin et de l'Œdicnème criard, qui se surajoutent aux échecs naturels dus aux aléas climatiques (crues tardives de printemps). Les pratiques agricoles liées à l'élevage bovin sont garantes du maintien des milieux prairiaux, favorables à la nidification du Râle des genêts et à l'alimentation d'espèces migratrices (Grande Aigrette, Pluvier doré). La modification des pratiques agricoles (amendements et fauches précoces des prairies, retournement de prairies pour la culture de céréales et de maïs) a restreint la superficie en prairies en bordure du Doubs, derrière les digues. Seule la vallée de la Breux et de la Charetelle (Charette, Lays-sur-le-Doubs, Pierre-de-Bresse) et certaines zones au bord du Doubs (Longepierre, Lays-sur-le-Doubs, Fretterans), encore en majorité prairiales, peuvent constituer le dernier refuge local pour le Râle des genêts. Les queues marécageuses des étangs se comblent naturellement et se peuplent de saules, écartant le Busard des roseaux, le Héron pourpré, le Blongios nain, au profit de la Gorgebleue à miroir, de l'Aigrette garzette, du Bihoreau gris et du Héron garde-boeuf. Le faucardage à but piscicole réduit ponctuellement la superficie des roselières, mais limite le boisement naturel des queues d'étangs au bénéfice des espèces des marais. La gestion de certaines bordures d'étangs à des fins cynégétiques (maintien d'une végétation arbustive et de roselières) est favorable à la nidification de l'avifaune d'intérêt communautaire (Héron pourpré). **Plan de gestion** : Document d'objectifs validé en 1998 pour le SIC FR2600981. Révision de ce document programmée en 2006. **Mesures de conservation** : Le document d’objectifs a été approuvé le 28 juin 2011. Le site est également désigné au titre de la directive « habitat – faune – flore » et fait l’objet d’un arrêté préfectoral de protection de biotope (APPB) sur le même périmètre que le site d’importance communautaire. Les enjeux majeurs sur ce site Natura 2000 ont été déclinés en fonction des six habitats d’espèces d’oiseaux identifiés : - le caractère pionnier et dynamique des milieux alluviaux propices à l’avifaune du lit vif du Doubs et des milieux associés (enjeu prioritaire), - la capacité d’accueil des formations ligneuses rivulaires en faveur de l’avifaune (enjeu prioritaire), - l’agriculture d’élevage en faveur des oiseaux nicheurs des prairies et milieux associés (enjeu prioritaire), - la pisciculture pour le maintien de l’avifaune des étangs, - le degré de naturalité des milieux forestiers, - la capacité d’accueil de l’habitat d’espèces des grandes cultures. Les objectifs sont les suivants : - maintenir les habitats d’espèces lies à la dynamique fluviale du lit vif du Doubs - garantir le maintien et la qualité de la ripisylve - augmenter l’attractivité du site pour les espèces patrimoniales inféodées aux milieux prairiaux et bocagers - maintenir des modes de gestion propices à l’avifaune des étangs - préserver la tranquillité qu’assurent les milieux forestiers pour l’avifaune.