Ontologia

Département Bouches-du-Rhône (13) · Région Provence-Alpes-Côte d’Azur

Écosystème de Marseille

886 040 habitants · INSEE 13055

Espèces observées

6 457

Observations

343 601

Superficie

237,8km²

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Laboratoire — outils applicables

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Outils exploratoires (Serrano 2009, Pocock 2012, Bascompte & Jordano 2007). Pas de prédiction — limites & transparence.

Profil écologique

Bêta

Six dimensions indépendantes + indice composite. Méthodologie inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (1984), Aronson (2014).

70.7/ 100

ICO — score d'ensemble

Brut 77.8 × confiance 91%

Score élevé, inventaire robuste (82 %).

  • 46 espèces endémiques ou subendémiques présentes.
Richesse98Patrimonial94Intégrité57Naturalité70Pression38Complétude82

Richesse documentée

98/100
Très élevé

Compare le nombre d'espèces de la commune à ce qu'on attendrait pour un territoire de cette taille. Un score élevé = plus riche que ce que la taille prédit (loi espèce-surface d'Arrhenius, ajustement z=0.30).

Méthode scientifique + valeurs brutes

Résidu de régression SAR (species-area relationship, Arrhenius 1921) : log(S_eval) − z·log(area_km²), où z est le coefficient empirique français (~0.20–0.30). Un résidu > 0 = plus d'espèces que ne le prédit la surface (signe positif), < 0 = moins qu'attendu (sous-inventaire ou écosystème pauvre). Le score final est le percentile national de ce résidu. Supérieur à S_eval/km² qui favorisait artificiellement les micro-communes.

2 317 esp. évaluées sur 237.8 km² (densité 9.7/km²)
résidu SAR 6.11 · rang national 98%
(ancien rang densité 11%, legacy)

Valeur patrimoniale

94/100
Élevé

Score composite ICO v2.1 : moitié espèces patrimoniales observées, moitié protection spatiale officielle (zones ZNIEFF, Natura 2000, réserves, parcs nationaux, Ramsar). Permet aux communes peu observées mais protégées d'être justement valorisées.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composition Option C par percentile rank pré-normalisé (Jenks & Caspall 1971) : patrimonial_v2 = 0.5 × percentile_v1 + 0.5 × percentile(patrim_bonus). v1 = somme cumulative pondérée par sévérité UICN (score 0 LC → 5 EX, principe Red List Index — Butchart et al. 2007) sur espèces patrimoniales (LR CR/EN/VU/NT, PN, DH, DO, PNA). Choix Type C Ontologia : poids 0.5/0.5 entre v1 (observation) et bonus spatial (protection). patrim_bonus = somme pondérée des % surface communale recouverts par 8 catégories de zones protégées : 0.25 ZNIEFF I cont. + 0.05 ZNIEFF marine + 0.25 Natura 2000 (ZSC ∪ ZPS) + 0.20 réserves strictes (RNN/APB/PN cœur, IUCN I-IV) + 0.10 Ramsar+Biosphère + 0.05 ZNIEFF II + 0.07 PNR+sites classés (IUCN V) + 0.03 foncier (CEN/CDL). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Refs : Dudley 2008 (IUCN PA Categories), Watson 2014 (Nature, performance PA), Horellou 2013 (Guide ZNIEFF MNHN/SPN), Touroult 2022 (BDJ), Maiorano 2015 (Conservation Biology), Jantke 2011, Boakes 2010 (biais d'effort). Masqué si Chao1 completeness < 30 %.

Affichage dual :
Patrimoine observé (v1) : 100.0% percentile national
Protection spatiale (bonus) : 88.9% percentile national
Score synthèse v2.1 : 94.5/100
117 menacées · 227 DH/DO · 154 PNA · bonus brut 0.222

Intégrité du réseau

57/100
Élevé

Densité et diversité des interactions écologiques (prédation, pollinisation, symbioses...) du sous-graphe local.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (0.5 × connectance relative + 0.5 × diversité typologique). Connectance C = L/(S·(S-1)) normalisée par 0.05 (valeur référence des réseaux écologiques, May 1972 / Dunne 2002). Diversité = n_types / 13 types possibles d'interactions (prédation, parasitisme, pollinisation, etc.). Valeur absolue sans référence de communes similaires ; une version future stratifiera par biome dominant + bio-région.

4265 sp. dans le réseau · 132049 arêtes
C = 0.0073 · 13 / 13 types

Naturalité

70/100
Élevé

Les espèces observées ici vivent-elles dans des milieux naturels (forêts, landes, tourbières) ou anthropisés (agricole, urbain) ?

Méthode scientifique + valeurs brutes

Score bipolaire Jaccard-like [-1,+1] → [0,100] sur biomes EUNIS niveau 1 (habitats is_main=true), pondéré par log(1+observation_count) pour atténuer le biais synanthrope. Paramètre prairie_mode pour l'ambiguïté E (prairies). Ne confond pas avec la pression anthropique.

w_nat 340.9 · w_anthr 94.5 · w_E 189.1
mode E : neutral

Pression anthropique

38/100
Modérée

Empreinte humaine : densité démographique, proportion d'espèces introduites, dominance des milieux cultivés/urbains.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (30% densité humaine percentile + 30% ratio espèces introduites/envahissantes + 40% dominance biomes EUNIS I+J). Délibérément SÉPARÉ de la naturalité : cet axe mesure l'anthropisation, la naturalité mesure l'écologie pure.

densité rang 99% · intro 395 · invas. 50
biomes anthr. 15%

Complétude d'inventaire

82/100
Bien inventorié

% estimé d'espèces réellement présentes qui ont été observées. Basse = la commune est sous-prospectée.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Estimateur Chao1 (Chao 1984). S_est = S_obs + f1²/(2·f2), où f1 = singletons, f2 = doubletons. Biais : sous-estime la richesse si effort très faible. Sert de facteur de confiance √completude pour pondérer l'ICO composite.

observées 6 184 / estimées 7 496
f1 = 1483 · f2 = 838
Méthodologie : indicateurs multidimensionnels calculés à partir de TAXREF v18, BDC-Statuts INPN, HABREF v7 (EUNIS 2012), Liste Rouge UICN France, GloBI. Approche inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (estimateur de richesse, 1984), Aronson et al. (urban biodiversity, 2014).
Limite : ces scores reposent sur des observations volontaires hétérogènes et n'équivalent pas un diagnostic écologique de terrain. L'intégrité du réseau trophique est en cours de développement et non incluse dans le composite pour cette version.

Protection spatiale

Surface communale couverte par les dispositifs officiels de conservation (INPN/PatriNat).

Surface protégée totale

43.4%

de la commune sous au moins un dispositif (union géométrique)

Rang national de protection

88.9%

percentile rank du bonus patrimonial spatial

Décomposition par catégorie

Natura 2000 (ZSC + ZPS)(poids 0.25)33.1%
Réserves strictes (RNN/APB/PN)(poids 0.20)28.3%
Ramsar + Biosphère UNESCO(poids 0.10)33.8%
PNR + parcs adhésion + Sites classés(poids 0.07)27.4%
ZNIEFF type II(poids 0.05)38.6%
ZNIEFF type I continentales(poids 0.25)3.4%
Foncier (CEN, Conservatoire littoral)(poids 0.03)5.1%
ZNIEFF marines(poids 0.05)0.0%

Données : INPN / PatriNat (pack 2026-01). Méthodologie : pondération Type C Ontologia inspirée de Dudley (2008), Watson (2014), Horellou (2013) et Maiorano (2015). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Le score est une densité par km², pas une masse absolue.

Profil environnemental de Marseille

13 sources scientifiques agrégées par commune. Sources et licences

Climat

Köppen · SAFRAN · CHELSA · DRIAS-2050
CsaMéditerranéen sec et chaud(98 % dominante)
T moy. annuelle
15,5 °C
SAFRAN 1991-2020
Précip. annuelles
535 mm
SAFRAN 1991-2020
T moy. été (JJA)
23,5 °C
T moy. hiver (DJF)
8,3 °C
T min janvier
5,3 °C
T max juillet
28,6 °C
Précip. été
57 mm
Précip. hiver
126 mm
Neige (cumul)
2 mm
Humidité sol moy.
0,39
SWI
Évapotranspiration
1 138 mm
ETP annuelle
Variables bioclimatiques CHELSA (détails)
T max mois plus chaud
25,9 °C
bio5
T min mois plus froid
4,8 °C
bio6 — gel hivernal
Amplitude T annuelle
21,1 °C
bio7 — continentalité
Saisonnalité T
543
bio4 (σ × 100)
Saisonnalité précip.
44
bio15 (CV)
Précip. été (CHELSA)
69 mm
bio18 — sécheresse Méditerranée
Précip. hiver (CHELSA)
165 mm
bio19

Projection 2050 (DRIAS GWL20, +2,7 °C global)

Δ T : +1.7 °C
T moy. proj.
17,3 °C
T max été proj.
28,8 °C
Jours canicule (Tx ≥ 35 °C)
2,1 j/an
Jours chauds (Tx ≥ 30 °C)
37,8 j/an
Nuits tropicales
82,3 j/an
Tn ≥ 20 °C
Jours secs (SWI ≤ 0,4)
213 j/an
+18.7 j vs réf.
Jours feu météo (IFM ≥ 40)
47,3 j/an
+10.7 j vs réf.
Précip. extrême (24 h)
49 mm
max sur 1 jour

Sol & géologie

SoilGrids 2.0 · BRGM 1M
Calcaires, marnes et gypse(63 % de la surface)Roches Sédimentairescalcicole
pH H₂O (0-5 cm)
7,4(neutre)
Carbone organique
56,7 g/kg
Azote total
3,09 g/kg
CEC
22,7 cmol⁺/kg
Densité apparente
1,29 g/cm³
Fragments grossiers
16 %

Texture (0-5 cm) · limono-argileux

Sable 30 %Limon 41 %Argile 29 %

Paysage

DEM · Corine LC · Hansen · OSM

Occupation du sol · dominante : Tissu urbain discontinu (41 %)

Urbain 57 %Agricole 1 %Forêt+naturel 42 %Eau 0 %
Altitude moy.
147 m(plaine)
Altitude max
642 m
Altitude min
-1 m
Rugosité du relief
115 m
σ altitude — ↑ = vallées
Couvert forestier
5,3 %
Hansen 2000
Densité routière
19,5 km/km²
Densité de haies
0,04 km/km²
Cours d'eau
188,3 km
Lieux-dits
63

Pression anthropique

VIIRS · Naïades · BNV-D
Pollution lumineuse
26,1 nW/cm²/sr(urbain)
min 0 · max 169
Qualité de l'eau (SEQ-Eau)
Classe 2 · bonne
12 stations · 1192 analyses · 2020-2025
NO₃: 8,3 mg/L· PO₄: 0,12 mg/L· NH₄: 0,04 mg/L· O₂: 9,9 mg/L

Pesticides — achats par CP

BNV-D 2020-2024
Total
6 498 kg/an
Dont CMR
449 kg/an
Herbicides
1 385 kg/an
Fongicides
4 977 kg/an
Insecticides
101 kg/an
Autres
36 kg/an
Substances distinctes
157

Achats déclarés par les distributeurs phytopharmaceutiques, agrégés par code postal puis projetés à la commune. Approximation pour les grandes communes (multi-CP).

En bref

La commune de Marseille (code INSEE 13055) est située dans le département Bouches-du-Rhône (13), en région Provence-Alpes-Côte d’Azur. Elle couvre 237.8 km² pour une population de 886 040 habitants (densité : 3 726 hab/km², zone urbaine).

La biodiversité documentée y compte 6 457 espèces observées au total, dont 2 317 évaluées sur la Liste Rouge française. Parmi ces dernières, 117 sont classées menacées (CR, EN ou VU), 392 bénéficient d’une protection réglementaire nationale, 227 sont listées aux Directives européennes Habitats ou Oiseaux, 154 font l’objet d’un Plan National d’Actions. Le volume d’observations cumulées est de 343 601.

L’indicateur composite écologique (ICO) s’établit à 70.7/100. Score élevé, inventaire robuste (82 %). Les habitats dominants déduits des espèces observées sont : Pelouses calcaires vivaces et steppes riches en bases · Falaises, corniches et rivages rocheux, incluant le supralittoral · Bâtiments des villes et des villages. La répartition taxonomique fait apparaître Animalia (61 %), Plantae (34 %), Fungi (3 %) comme principaux règnes représentés.

Parmi les espèces patrimoniales observées localement, Dermochelys coriacea (Tortue luth (La)) figure parmi les plus remarquables au regard de ses statuts de conservation.

Source : Ontologia (synthèse)

Espèces patrimoniales ici

Data officielle
Voir toutes les espèces observées sur Marseille

Les 12 espèces les plus à enjeu de Marseille. Sources : BDC-Statuts v18 (INPN) × observations GBIF/INPN.

Affinités écologiques des espèces

Dérivé

Vers quels milieux tendent les espèces observées ici — pas une cartographie au sol.

  • Prairiale28%
  • Littorale5%
  • Rupicole6%
  • Urbaine8%
  • Aquatique11%
  • Forestière29%
  • Landes et fourrés12%

Agrégé depuis les habitats préférentiels HABREF (INPN) des espèces observées localement. Pour la cartographie du couvert au sol : CarHab (IGN).

Contexte géographique

Nombre d’espèces observées

Compte direct des espèces distinctes observées dans chaque commune. Simple et intuitif, mais biaisé par la présence d’observateurs (les grandes villes dominent mécaniquement).

Commune centrale en bordure foncée pointillée, voisines en aplat. Cliquez sur une voisine pour naviguer.

Très peu(< 50)Peu(50-200)Moyen(200-800)Beaucoup(800-2 000)Hotspot(> 2 000)
Zones chaudes d’observations à l’intérieur de la commune (heatmap GBIF)