Ontologia

Département Rhône (69) · Région Auvergne-Rhône-Alpes

Écosystème de Lyon

519 127 habitants · INSEE 69123

Espèces observées

3 772

Observations

65 297

Superficie

48km²

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Laboratoire — outils applicables

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Outils exploratoires (Serrano 2009, Pocock 2012, Bascompte & Jordano 2007). Pas de prédiction — limites & transparence.

Plantes à privilégierRecommandation aménagementPollinisateurs d’un milieuJardin, prairie, mare…Espèces parapluieSet cover des interactionsPartenaires absentsDiff local vs nationalComparer avec un autre territoireMétriques côte à côteRobustesse du réseauR-curve Pocock 2012

Profil écologique

Bêta

Six dimensions indépendantes + indice composite. Méthodologie inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (1984), Aronson (2014).

59/ 100

ICO — score d'ensemble

Brut 70.5 × confiance 84%

Score modéré, inventaire robuste (70 %).

  • • 14 espèces endémiques ou subendémiques présentes.
Richesse99Patrimonial63Intégrité62Naturalité70Pression43Complétude70

Richesse documentée

99/100
Très élevé

Compare le nombre d'espèces de la commune à ce qu'on attendrait pour un territoire de cette taille. Un score élevé = plus riche que ce que la taille prédit (loi espèce-surface d'Arrhenius, ajustement z=0.30).

Méthode scientifique + valeurs brutes

Résidu de régression SAR (species-area relationship, Arrhenius 1921) : log(S_eval) − z·log(area_km²), où z est le coefficient empirique français (~0.20–0.30). Un résidu > 0 = plus d'espèces que ne le prédit la surface (signe positif), < 0 = moins qu'attendu (sous-inventaire ou écosystème pauvre). Le score final est le percentile national de ce résidu. Supérieur à S_eval/km² qui favorisait artificiellement les micro-communes.

1 788 esp. évaluées sur 48.0 km² (densité 37.3/km²)
résidu SAR 6.33 · rang national 99%
(ancien rang densité 69%, legacy)

Valeur patrimoniale

63/100
Modéré

Score composite ICO v2.1 : moitié espèces patrimoniales observées, moitié protection spatiale officielle (zones ZNIEFF, Natura 2000, réserves, parcs nationaux, Ramsar). Permet aux communes peu observées mais protégées d'être justement valorisées.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composition Option C par percentile rank pré-normalisé (Jenks & Caspall 1971) : patrimonial_v2 = 0.5 × percentile_v1 + 0.5 × percentile(patrim_bonus). v1 = somme cumulative pondérée par sévérité UICN (score 0 LC → 5 EX, principe Red List Index — Butchart et al. 2007) sur espèces patrimoniales (LR CR/EN/VU/NT, PN, DH, DO, PNA). Choix Type C Ontologia : poids 0.5/0.5 entre v1 (observation) et bonus spatial (protection). patrim_bonus = somme pondérée des % surface communale recouverts par 8 catégories de zones protégées : 0.25 ZNIEFF I cont. + 0.05 ZNIEFF marine + 0.25 Natura 2000 (ZSC ∪ ZPS) + 0.20 réserves strictes (RNN/APB/PN cœur, IUCN I-IV) + 0.10 Ramsar+Biosphère + 0.05 ZNIEFF II + 0.07 PNR+sites classés (IUCN V) + 0.03 foncier (CEN/CDL). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Refs : Dudley 2008 (IUCN PA Categories), Watson 2014 (Nature, performance PA), Horellou 2013 (Guide ZNIEFF MNHN/SPN), Touroult 2022 (BDJ), Maiorano 2015 (Conservation Biology), Jantke 2011, Boakes 2010 (biais d'effort). Masqué si Chao1 completeness < 30 %.

Affichage dual :
Patrimoine observé (v1) : 99.3% percentile national
Protection spatiale (bonus) : 27.4% percentile national
Score synthèse v2.1 : 63.3/100
61 menacées · 135 DH/DO · 79 PNA · bonus brut 0.004

Intégrité du réseau

62/100
Élevé

Densité et diversité des interactions écologiques (prédation, pollinisation, symbioses...) du sous-graphe local.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (0.5 × connectance relative + 0.5 × diversité typologique). Connectance C = L/(S·(S-1)) normalisée par 0.05 (valeur référence des réseaux écologiques, May 1972 / Dunne 2002). Diversité = n_types / 13 types possibles d'interactions (prédation, parasitisme, pollinisation, etc.). Valeur absolue sans référence de communes similaires ; une version future stratifiera par biome dominant + bio-région.

2940 sp. dans le réseau · 107527 arêtes
C = 0.0124 · 13 / 13 types

Naturalité

70/100
Élevé

Les espèces observées ici vivent-elles dans des milieux naturels (forêts, landes, tourbières) ou anthropisés (agricole, urbain) ?

Méthode scientifique + valeurs brutes

Score bipolaire Jaccard-like [-1,+1] → [0,100] sur biomes EUNIS niveau 1 (habitats is_main=true), pondéré par log(1+observation_count) pour atténuer le biais synanthrope. Paramètre prairie_mode pour l'ambiguïté E (prairies). Ne confond pas avec la pression anthropique.

w_nat 95.2 · w_anthr 36.4 · w_E 12.0
mode E : neutral

Pression anthropique

43/100
Modérée

Empreinte humaine : densité démographique, proportion d'espèces introduites, dominance des milieux cultivés/urbains.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (30% densité humaine percentile + 30% ratio espèces introduites/envahissantes + 40% dominance biomes EUNIS I+J). Délibérément SÉPARÉ de la naturalité : cet axe mesure l'anthropisation, la naturalité mesure l'écologie pure.

densité rang 100% · intro 335 · invas. 52
biomes anthr. 25%

Complétude d'inventaire

70/100
Bien inventorié

% estimé d'espèces réellement présentes qui ont été observées. Basse = la commune est sous-prospectée.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Estimateur Chao1 (Chao 1984). S_est = S_obs + f1²/(2·f2), où f1 = singletons, f2 = doubletons. Biais : sous-estime la richesse si effort très faible. Sert de facteur de confiance √completude pour pondérer l'ICO composite.

observées 3 528 / estimées 5 039
f1 = 1275 · f2 = 538
Méthodologie : indicateurs multidimensionnels calculés à partir de TAXREF v18, BDC-Statuts INPN, HABREF v7 (EUNIS 2012), Liste Rouge UICN France, GloBI. Approche inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (estimateur de richesse, 1984), Aronson et al. (urban biodiversity, 2014).
Limite : ces scores reposent sur des observations volontaires hétérogènes et n'équivalent pas un diagnostic écologique de terrain. L'intégrité du réseau trophique est en cours de développement et non incluse dans le composite pour cette version.

Protection spatiale

Surface communale couverte par les dispositifs officiels de conservation (INPN/PatriNat).

Surface protégée totale

7.4%

de la commune sous au moins un dispositif (union géométrique)

Rang national de protection

27.4%

percentile rank du bonus patrimonial spatial

Décomposition par catégorie

ZNIEFF type II(poids 0.05)7.3%
ZNIEFF type I continentales(poids 0.25)0.0%
Natura 2000 (ZSC + ZPS)(poids 0.25)0.0%
Réserves strictes (RNN/APB/PN)(poids 0.20)0.0%
Ramsar + Biosphère UNESCO(poids 0.10)0.0%
PNR + parcs adhésion + Sites classés(poids 0.07)0.2%
ZNIEFF marines(poids 0.05)0.0%
Foncier (CEN, Conservatoire littoral)(poids 0.03)0.0%

Données : INPN / PatriNat (pack 2026-01). Méthodologie : pondération Type C Ontologia inspirée de Dudley (2008), Watson (2014), Horellou (2013) et Maiorano (2015). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Le score est une densité par km², pas une masse absolue.

Profil environnemental de Lyon

13 sources scientifiques agrégées par commune. Sources et licences

Climat

Köppen · SAFRAN · CHELSA · DRIAS-2050
CfaSubtropical humide(87 % dominante)
T moy. annuelle
12,7 °C
SAFRAN 1991-2020
Précip. annuelles
820 mm
SAFRAN 1991-2020
T moy. été (JJA)
21,5 °C
T moy. hiver (DJF)
4,3 °C
T min janvier
1,6 °C
T max juillet
26,6 °C
Précip. été
205 mm
Précip. hiver
147 mm
Neige (cumul)
18 mm
Humidité sol moy.
0,61
SWI
Évapotranspiration
885 mm
ETP annuelle
Variables bioclimatiques CHELSA (détails)
T max mois plus chaud
26,2 °C
bio5
T min mois plus froid
-0,3 °C
bio6 — gel hivernal
Amplitude T annuelle
26,5 °C
bio7 — continentalité
Saisonnalité T
649
bio4 (σ × 100)
Saisonnalité précip.
23
bio15 (CV)
Précip. été (CHELSA)
207 mm
bio18 — sécheresse Méditerranée
Précip. hiver (CHELSA)
151 mm
bio19

Projection 2050 (DRIAS GWL20, +2,7 °C global)

Δ T : +1.6 °C
T moy. proj.
14,3 °C
T max été proj.
27,4 °C
Jours canicule (Tx ≥ 35 °C)
5,1 j/an
Jours chauds (Tx ≥ 30 °C)
32,9 j/an
Nuits tropicales
38,6 j/an
Tn ≥ 20 °C
Jours secs (SWI ≤ 0,4)
107,7 j/an
+28.7 j vs réf.
Jours feu météo (IFM ≥ 40)
9,7 j/an
+3.7 j vs réf.
Précip. extrême (24 h)
59 mm
max sur 1 jour

Sol & géologie

SoilGrids 2.0 · BRGM 1M
Sables(42 % de la surface)Roches Sédimentaires
pH H₂O (0-5 cm)
6,5(légèrement acide)
Carbone organique
59,3 g/kg
Azote total
6 g/kg
CEC
28 cmol⁺/kg
Densité apparente
1,23 g/cm³
Fragments grossiers
12 %

Texture (0-5 cm) · limoneux

Sable 33 %Limon 42 %Argile 25 %

Paysage

DEM · Corine LC · Hansen · OSM

Occupation du sol · dominante : Tissu urbain discontinu (36 %)

Urbain 93 %Agricole 0 %Forêt+naturel 0 %Eau 7 %
Altitude moy.
193 m(plaine)
Altitude max
318 m
Altitude min
159 m
Rugosité du relief
37 m
σ altitude — ↑ = vallées
Couvert forestier
3,6 %
Hansen 2000
Densité routière
48,8 km/km²
Densité de haies
0,65 km/km²
Cours d'eau
31,4 km
Lieux-dits
7

Pression anthropique

VIIRS · Naïades · BNV-D
Pollution lumineuse
43,7 nW/cm²/sr(urbain)
min 11,9 · max 87,6
Qualité de l'eau (SEQ-Eau)
Classe 2 · bonne
6 stations · 336 analyses · 2020-2025
NO₃: 16,8 mg/L· PO₄: 0,08 mg/L· NH₄: 0,05 mg/L· O₂: 10,3 mg/L

Pesticides — achats par CP

BNV-D 2020-2024
Total
8 712 kg/an
Dont CMR
393 kg/an
Herbicides
1 256 kg/an
Fongicides
7 160 kg/an
Insecticides
218 kg/an
Autres
78 kg/an
Substances distinctes
173

Achats déclarés par les distributeurs phytopharmaceutiques, agrégés par code postal puis projetés à la commune. Approximation pour les grandes communes (multi-CP).

En bref

La commune de Lyon (code INSEE 69123) est située dans le département Rhône (69), en région Auvergne-Rhône-Alpes. Elle couvre 48.0 km² pour une population de 519 127 habitants (densité : 10 820 hab/km², zone très dense).

La biodiversité documentée y compte 3 772 espèces observées au total, dont 1 788 évaluées sur la Liste Rouge française. Parmi ces dernières, 61 sont classées menacées (CR, EN ou VU), 230 bénéficient d’une protection réglementaire nationale, 135 sont listées aux Directives européennes Habitats ou Oiseaux, 79 font l’objet d’un Plan National d’Actions. Le volume d’observations cumulées est de 65 297.

L’indicateur composite écologique (ICO) s’établit à 59/100. Score modéré, inventaire robuste (70 %). Les habitats dominants déduits des espèces observées sont : Bâtiments des villes et des villages · Eaux dormantes de surface · Falaises continentales, pavements rocheux et affleurements rocheux. La répartition taxonomique fait apparaître Animalia (44 %), Plantae (50 %), Fungi (6 %) comme principaux règnes représentés.

Parmi les espèces patrimoniales observées localement, Pseudunio auricularius (Grande mulette) figure parmi les plus remarquables au regard de ses statuts de conservation.

Source : Ontologia (synthèse)

Espèces patrimoniales ici

Data officielle
Voir toutes les espèces observées sur Lyon →

Les 12 espèces les plus à enjeu de Lyon. Sources : BDC-Statuts v18 (INPN) × observations GBIF/INPN.

Affinités écologiques des espèces

Dérivé

Vers quels milieux tendent les espèces observées ici — pas une cartographie au sol.

  • Urbaine11%
  • Aquatique25%
  • Forestière42%
  • Prairiale8%
  • Rupicole5%
  • Littorale2%
  • Landes et fourrés3%
  • Zones humides4%

Agrégé depuis les habitats préférentiels HABREF (INPN) des espèces observées localement. Pour la cartographie du couvert au sol : CarHab (IGN).

Contexte géographique

Nombre d’espèces observées

Compte direct des espèces distinctes observées dans chaque commune. Simple et intuitif, mais biaisé par la présence d’observateurs (les grandes villes dominent mécaniquement).

Commune centrale en bordure foncée pointillée, voisines en aplat. Cliquez sur une voisine pour naviguer.

Très peu(< 50)Peu(50-200)Moyen(200-800)Beaucoup(800-2 000)Hotspot(> 2 000)
Zones chaudes d’observations à l’intérieur de la commune (heatmap GBIF)