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Département Yonne (89) · Région Bourgogne-Franche-Comté

Écosystème de Joigny

9 016 habitants · INSEE 89206

Espèces observées

1 012

Observations

16 722

Superficie

47,2km²

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Laboratoire — outils applicables

Tous les outils →

Outils exploratoires (Serrano 2009, Pocock 2012, Bascompte & Jordano 2007). Pas de prédiction — limites & transparence.

Plantes à privilégierRecommandation aménagement Pollinisateurs d’un milieuJardin, prairie, mare…Espèces parapluieSet cover des interactions Partenaires absentsDiff local vs national Comparer avec un autre territoireMétriques côte à côte Robustesse du réseauR-curve Pocock 2012

Profil écologique

Bêta

Six dimensions indépendantes + indice composite. Méthodologie inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (1984), Aronson (2014).

66.4/ 100

ICO — score d'ensemble

Brut 72.2 × confiance 92%

Score élevé, inventaire quasi-complet (85 %).

• 1 espèce endémique ou subendémique présente.

Richesse documentée

73/100

Élevé

Compare le nombre d'espèces de la commune à ce qu'on attendrait pour un territoire de cette taille. Un score élevé = plus riche que ce que la taille prédit (loi espèce-surface d'Arrhenius, ajustement z=0.30).

Méthode scientifique + valeurs brutes

Résidu de régression SAR (species-area relationship, Arrhenius 1921) : log(S_eval) − z·log(area_km²), où z est le coefficient empirique français (~0.20–0.30). Un résidu > 0 = plus d'espèces que ne le prédit la surface (signe positif), < 0 = moins qu'attendu (sous-inventaire ou écosystème pauvre). Le score final est le percentile national de ce résidu. Supérieur à S_eval/km² qui favorisait artificiellement les micro-communes.

705 esp. évaluées sur 47.2 km² (densité 14.9/km²)
résidu SAR 5.40 · rang national 73%
(ancien rang densité 22%, legacy)

Valeur patrimoniale

70/100

Modéré

Score composite ICO v2.1 : moitié espèces patrimoniales observées, moitié protection spatiale officielle (zones ZNIEFF, Natura 2000, réserves, parcs nationaux, Ramsar). Permet aux communes peu observées mais protégées d'être justement valorisées.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composition Option C par percentile rank pré-normalisé (Jenks & Caspall 1971) : patrimonial_v2 = 0.5 × percentile_v1 + 0.5 × percentile(patrim_bonus). v1 = somme cumulative pondérée par sévérité UICN (score 0 LC → 5 EX, principe Red List Index — Butchart et al. 2007) sur espèces patrimoniales (LR CR/EN/VU/NT, PN, DH, DO, PNA). Choix Type C Ontologia : poids 0.5/0.5 entre v1 (observation) et bonus spatial (protection). patrim_bonus = somme pondérée des % surface communale recouverts par 8 catégories de zones protégées : 0.25 ZNIEFF I cont. + 0.05 ZNIEFF marine + 0.25 Natura 2000 (ZSC ∪ ZPS) + 0.20 réserves strictes (RNN/APB/PN cœur, IUCN I-IV) + 0.10 Ramsar+Biosphère + 0.05 ZNIEFF II + 0.07 PNR+sites classés (IUCN V) + 0.03 foncier (CEN/CDL). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Refs : Dudley 2008 (IUCN PA Categories), Watson 2014 (Nature, performance PA), Horellou 2013 (Guide ZNIEFF MNHN/SPN), Touroult 2022 (BDJ), Maiorano 2015 (Conservation Biology), Jantke 2011, Boakes 2010 (biais d'effort). Masqué si Chao1 completeness < 30 %.

Affichage dual :
Patrimoine observé (v1) : 88.7% percentile national
Protection spatiale (bonus) : 51.1% percentile national
Score synthèse v2.1 : 69.9/100
20 menacées · 85 DH/DO · 13 PNA · bonus brut 0.041

Intégrité du réseau

95/100

Très élevé

Densité et diversité des interactions écologiques (prédation, pollinisation, symbioses...) du sous-graphe local.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (0.5 × connectance relative + 0.5 × diversité typologique). Connectance C = L/(S·(S-1)) normalisée par 0.05 (valeur référence des réseaux écologiques, May 1972 / Dunne 2002). Diversité = n_types / 13 types possibles d'interactions (prédation, parasitisme, pollinisation, etc.). Valeur absolue sans référence de communes similaires ; une version future stratifiera par biome dominant + bio-région.

900 sp. dans le réseau · 36402 arêtes
C = 0.0450 · 13 / 13 types

Naturalité

62/100

Élevé

Les espèces observées ici vivent-elles dans des milieux naturels (forêts, landes, tourbières) ou anthropisés (agricole, urbain) ?

Méthode scientifique + valeurs brutes

Score bipolaire Jaccard-like [-1,+1] → [0,100] sur biomes EUNIS niveau 1 (habitats is_main=true), pondéré par log(1+observation_count) pour atténuer le biais synanthrope. Paramètre prairie_mode pour l'ambiguïté E (prairies). Ne confond pas avec la pression anthropique.

w_nat 31.3 · w_anthr 18.3 · w_E 4.5
mode E : neutral

Pression anthropique

42/100

Modérée

Empreinte humaine : densité démographique, proportion d'espèces introduites, dominance des milieux cultivés/urbains.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Composite (30% densité humaine percentile + 30% ratio espèces introduites/envahissantes + 40% dominance biomes EUNIS I+J). Délibérément SÉPARÉ de la naturalité : cet axe mesure l'anthropisation, la naturalité mesure l'écologie pure.

densité rang 87% · intro 56 · invas. 17
biomes anthr. 34%

Complétude d'inventaire

85/100

Très bien inventorié

% estimé d'espèces réellement présentes qui ont été observées. Basse = la commune est sous-prospectée.

Méthode scientifique + valeurs brutes

Estimateur Chao1 (Chao 1984). S_est = S_obs + f1²/(2·f2), où f1 = singletons, f2 = doubletons. Biais : sous-estime la richesse si effort très faible. Sert de facteur de confiance √completude pour pondérer l'ICO composite.

observées 955 / estimées 1 128
f1 = 207 · f2 = 124

Méthodologie : indicateurs multidimensionnels calculés à partir de TAXREF v18, BDC-Statuts INPN, HABREF v7 (EUNIS 2012), Liste Rouge UICN France, GloBI. Approche inspirée de Butchart et al. (Red List Index, 2007), Chao (estimateur de richesse, 1984), Aronson et al. (urban biodiversity, 2014).
Limite : ces scores reposent sur des observations volontaires hétérogènes et n'équivalent pas un diagnostic écologique de terrain. L'intégrité du réseau trophique est en cours de développement et non incluse dans le composite pour cette version.

Protection spatiale

Surface communale couverte par les dispositifs officiels de conservation (INPN/PatriNat).

🛡 Hotspot protégé

Surface protégée totale

73.0%

de la commune sous au moins un dispositif (union géométrique)

Rang national de protection

51.1%

percentile rank du bonus patrimonial spatial

Décomposition par catégorie

ZNIEFF type II(poids 0.05)73.0%

ZNIEFF type I continentales(poids 0.25)1.6%

Natura 2000 (ZSC + ZPS)(poids 0.25)0.0%

Réserves strictes (RNN/APB/PN)(poids 0.20)0.0%

Ramsar + Biosphère UNESCO(poids 0.10)0.0%

PNR + parcs adhésion + Sites classés(poids 0.07)0.0%

ZNIEFF marines(poids 0.05)0.0%

Foncier (CEN, Conservatoire littoral)(poids 0.03)0.0%

Données : INPN / PatriNat (pack 2026-01). Méthodologie : pondération Type C Ontologia inspirée de Dudley (2008), Watson (2014), Horellou (2013) et Maiorano (2015). UNION géométrique par catégorie pour éviter le double-comptage. Le score est une densité par km², pas une masse absolue.

Profil environnemental de Joigny

13 sources scientifiques agrégées par commune. Sources et licences

Climat

Köppen · SAFRAN · CHELSA · DRIAS-2050

CfbOcéanique(100 % dominante)

T moy. annuelle: 11,2 °C; SAFRAN 1991-2020
Précip. annuelles: 768 mm; SAFRAN 1991-2020
T moy. été (JJA): 19 °C
T moy. hiver (DJF): 4,1 °C
T min janvier: 1,6 °C
T max juillet: 24,8 °C
Précip. été: 178 mm
Précip. hiver: 200 mm
Neige (cumul): 16 mm
Humidité sol moy.: 0,61; SWI
Évapotranspiration: 737 mm; ETP annuelle

Variables bioclimatiques CHELSA (détails)

T max mois plus chaud: 23,8 °C; bio5
T min mois plus froid: 0,4 °C; bio6 — gel hivernal
Amplitude T annuelle: 23,4 °C; bio7 — continentalité
Saisonnalité T: 581; bio4 (σ × 100)
Saisonnalité précip.: 11; bio15 (CV)
Précip. été (CHELSA): 190 mm; bio18 — sécheresse Méditerranée
Précip. hiver (CHELSA): 211 mm; bio19

Projection 2050 (DRIAS GWL20, +2,7 °C global)

Δ T : +1.9 °C

T moy. proj.: 13,2 °C
T max été proj.: 26,3 °C
Jours canicule (Tx ≥ 35 °C): 5,9 j/an
Jours chauds (Tx ≥ 30 °C): 25,3 j/an
Nuits tropicales: 12,5 j/an; Tn ≥ 20 °C
Jours secs (SWI ≤ 0,4): 121,7 j/an; +33.3 j vs réf.
Jours feu météo (IFM ≥ 40): 5,7 j/an; +4.3 j vs réf.
Précip. extrême (24 h): 41 mm; max sur 1 jour

Sol & géologie

SoilGrids 2.0 · BRGM 1M

Craie(47 % de la surface)Roches Sédimentairescalcicole

pH H₂O (0-5 cm): 5,6(acide)
Carbone organique: 62,6 g/kg
Azote total: 6,52 g/kg
CEC: 27,2 cmol⁺/kg
Densité apparente: 1,25 g/cm³
Fragments grossiers: 12 %

Texture (0-5 cm) · limoneux

Sable 25 %Limon 50 %Argile 24 %

Paysage

DEM · Corine LC · Hansen · OSM

Occupation du sol · dominante : Forêts de feuillus (40 %)

Urbain 13 %Agricole 15 %Forêt+naturel 70 %Eau 2 %

Altitude moy.: 182 m(plaine)
Altitude max: 275 m
Altitude min: 71 m
Rugosité du relief: 65 m; σ altitude — ↑ = vallées
Couvert forestier: 56,4 %; Hansen 2000
Densité routière: 6,1 km/km²
Densité de haies: 0,01 km/km²
Cours d'eau: 16,8 km
Lieux-dits: 3

Pression anthropique

VIIRS · Naïades · BNV-D

Pollution lumineuse: 0,9 nW/cm²/sr(rural sombre); min 0 · max 9,1

Pesticides — achats par CP

BNV-D 2020-2024

Total: 1 635 kg/an
Dont CMR: 383 kg/an
Herbicides: 1 053 kg/an
Fongicides: 351 kg/an
Insecticides: 67 kg/an
Autres: 164 kg/an
Substances distinctes: 163

Achats déclarés par les distributeurs phytopharmaceutiques, agrégés par code postal puis projetés à la commune. Approximation pour les grandes communes (multi-CP).

En bref

La commune de Joigny (code INSEE 89206) est située dans le département Yonne (89), en région Bourgogne-Franche-Comté. Elle couvre 47.2 km² pour une population de 9 016 habitants (densité : 191 hab/km², zone péri-urbaine).

La biodiversité documentée y compte 1 012 espèces observées au total, dont 705 évaluées sur la Liste Rouge française. Parmi ces dernières, 20 sont classées menacées (CR, EN ou VU), 152 bénéficient d’une protection réglementaire nationale, 85 sont listées aux Directives européennes Habitats ou Oiseaux, 13 font l’objet d’un Plan National d’Actions. Le volume d’observations cumulées est de 16 722.

L’indicateur composite écologique (ICO) s’établit à 66.4/100. Score élevé, inventaire quasi-complet (85 %). Les habitats dominants déduits des espèces observées sont : Eaux courantes de surface · Bâtiments des villes et des villages · Falaises, corniches et rivages rocheux, incluant le supralittoral. La répartition taxonomique fait apparaître Animalia (33 %), Plantae (65 %), Fungi (2 %) comme principaux règnes représentés.

Parmi les espèces patrimoniales observées localement, Milvus milvus (Milan royal) figure parmi les plus remarquables au regard de ses statuts de conservation.

Source : Ontologia (synthèse)

Espèces patrimoniales ici

Data officielle

Voir toutes les espèces observées sur Joigny →

Les 12 espèces les plus à enjeu de Joigny. Sources : BDC-Statuts v18 (INPN) × observations GBIF/INPN.

Affinités écologiques des espèces

Dérivé

Vers quels milieux tendent les espèces observées ici — pas une cartographie au sol.

Aquatique48%
Urbaine12%
Littorale5%
Forestière28%
Prairiale7%

Agrégé depuis les habitats préférentiels HABREF (INPN) des espèces observées localement. Pour la cartographie du couvert au sol : CarHab (IGN).

Contexte géographique

Nombre d’espèces observées

Compte direct des espèces distinctes observées dans chaque commune. Simple et intuitif, mais biaisé par la présence d’observateurs (les grandes villes dominent mécaniquement).

Commune centrale en bordure foncée pointillée, voisines en aplat. Cliquez sur une voisine pour naviguer.

Très peu(< 50)Peu(50-200)Moyen(200-800)Beaucoup(800-2 000)Hotspot(> 2 000)

Zones chaudes d’observations à l’intérieur de la commune (heatmap GBIF)